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应用特点是育果纸、育苗模铸容器填充剂。国内某企业，使用低品质硅藻土原料，经过特种予处置后用于制造育果纸，据称具有良好的保温保湿和促进果实生长的效果。将经过改性的硅藻土填充育苗纸模铸容器，用于农业育苗，据称具有杀菌、缓施、保温、保湿和促进植物生长的效果。
可以应用于过滤纸（板）填充剂。硅藻土已广泛用于有特种净化要求的酒类、饮料食品、医药、口服液、净化水、工业滤油滤芯和精细化工的过滤纸或纸板的填充剂。滤纸中填充硅藻土可有效提高过滤液体的廓清度和过滤效率。用银或其它具有杀（抑）菌功能的化合物予以改性的硅藻土填料，可以制造出具有杀（抑）菌功能的过滤纸和纸板。也可以用作蓄电池隔板填充剂。混合纸浆中填加硅藻土用于制造蓄电池隔板，利用硅藻土的多孔性，提高电池隔板的空隙率，以降低蓄电池隔板的电阻。但过量填加硅藻土会降低电池隔板的机械强度和使用寿命。